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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

聚焦网络强国、数字中国建设！光明网数字化频道2023年1月1日上线******

　　光明网讯（记者 李政葳）当前，我国网民规模已超10亿，形成全球最庞大的数字社会，数字经济也作为一种新的经济形态正在开启。为深入贯彻落实党的二十大精神，进一步聚焦网络强国、数字中国建设，不断发挥光明网自身优势做新做强互联网领域报道。光明网于2023年1月1日，开设光明网数字化频道（https://digital.gmw.cn/）。

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　　“党的二十大报告中提出，加快建设制造强国、质量强国、航天强国、交通强国、网络强国、数字中国。这将是当前和今后一个时期内，必须围绕的中心和服务的大局。”光明网相关负责人表示，上线数字化频道旨在顺应互联网时代发展大势对于网络强国、数字中国建设提出的一系列新任务、新部署、新要求，尤其是在服务中国式现代化建设、促进数字文明发展、加强信息基础设施建设、推动数字经济与实体经济融合的进程中，主流媒体应不断发挥引导能力，紧扣时代发展脉搏，营造良好舆论氛围。

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　　光明网数字化频道以“聚焦网络强国建设 关注数字化转型发展”为宗旨。从频道页面设计看，以互联网科技感十足的蓝绿色为主色系，各个元素模块实现图文相间、动态布局，既彰显了厚重、亲切、简约、大气的特色，又喻示着数字化转型发展一片蓝海，将有更多可能和未知有待开拓。

　　从频道板块架构看，页面设置了行业要闻、产业·技术、数字基建、云上生活、智慧城市、媒体融合、AI+、地方实践等板块，呈现数字化领域创新突破、产业落地、技术惠民的最新成果；为贯彻落实习近平总书记致光明日报创刊70周年贺信中的指示精神，进一步团结、联系、引导、服务知识界，频道设置评论观察、对话访谈等主题板块，作为业界精英为数字化转型发展、网络强国建设建言献策的重要平台；此外，频道还设置“E视线”板块，重点集纳行业热点动态、重要活动专题以及光明网自主策划品牌栏目等。

　　值得一提的是，作为互联网领域的重磅盛会，2022年世界互联网大会乌镇峰会首次以国际组织年会的形式举办。大会中文宣传项目由光明日报光明网承担，并在峰会期间推出系列峰会会刊等。为此，数字化频道在右侧显著位置设置峰会专区，链接大会官网入口以及大会微信、抖音二维码，并在该专区实时更新大会重要动态。

　　网络安全和信息化是一体之两翼、驱动之双轮。或许大家会疑问，为什么数字化频道没有设置网络安全类板块。其实，在2022年1月份，光明网便已单独开设了网络安全频道（https://wlaq.gmw.cn/）。在过去一年里，频道秉持“共建网络安全 共享网络文明”的宗旨，持续联动政产学研界，携手推进网络安全教育、技术、产业的融合发展。

　　新元肇启，美好如期。在接下来数字化频道运行中，如果您有什么意见建议，请告诉我们；如果您有哪些创新思路，也欢迎不吝赐教。相信在新的一年里，光明网的数字化频道将在您的支持与关注下不断演绎精彩。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）